En 2011, le Conseil Régional Nord-Pas de Calais confie à ATEMIS la mission d’accompagner un premier groupe de neuf PME dans l’évolution de leur modèle vers l’économie de la fonctionnalité et d’en tirer des recommandations en termes de politiques publiques. A cette occasion ATEMIS développe une méthodologie de diagnostic et d’accompagnement spécifique. Depuis lors, ATEMIS anime, ou co-anime des dynamiques d’accompagnement collectif de dirigeants de PME/ETI vers l’économie de la fonctionnalité. Fin 2015 environ quatre-vingt de TPE/PME ont suivi un parcours dans ce cadre.
L’accompagnement d’entreprises prend également d’autres formes telles que l’animation d’un groupe d’acteurs économiques autour de la sphère de l’Habiter, en lien avec le Club Noé, ou des accompagnements individuels de dirigeants ou de collectifs au sein d’entreprises.